御三家的获取方式其实并不复杂。尼比市可以遇到豪力或怪力，华蓝市能捕捉到皮皮或皮可西，枯叶市有马沙和拉普拉斯，而红莲岛则是小火龙、火恐龙和喷火龙的栖息地。这些地点都是经过玩家验证的可靠捕捉点，不过具体出现概率可能会有所波动。想要提高效率的话，建议在探索时多存档，这样遇到不满意的个体还能重新读档。记得带上足够的精灵球和状态恢复道具，毕竟御三家作为稀有宝可梦，捕捉难度会比普通野生宝可梦高一些。
常磐森林的草地是寻找妙蛙种子的好地方，那里的环境非常适合草系宝可梦生活。华蓝市左侧的草地和岩山洞穴经常有小火龙出没，它们喜欢在干燥温暖的环境中活动。至于杰尼龟，枯叶市附近的水域是它们的主要栖息地，使用钓竿会比在草丛中随机遇到更有效率。不同时间段出现的概率可能会有差异，所以不妨多尝试在不同时间探索。如果遇到闪光御三家那就更幸运了，虽然概率很低但确实存在这种可能性。
收集全部御三家的话，需要耐心地往返于各个城市之间。红莲岛的小火龙进化链比较特殊，从初期形态到最终形态都能在这里找到。尼比市的岩石系道馆附近也偶尔会出现御三家，这可能和游戏的特殊设定有关。有些玩家发现特定天气条件下遇到御三家的概率会提升，比如小火龙在晴天更容易出现。虽然这不是官方确认的机制，但确实值得尝试。记得在捕捉前查看宝可梦的性格和个体值，这对后期培养很重要。
游戏中期开始，御三家的进化形态会陆续出现在更多区域。喷火龙不仅能在红莲岛找到，某些特殊山洞也可能遇到。水箭龟除了枯叶市外，部分海域通过冲浪也能遇见。妙蛙花的分布相对集中，主要在常磐森林和华蓝市周边。如果发现某个地点长时间遇不到目标，不妨换个区域试试。游戏中的昼夜系统可能会影响出现种类，这点在攻略中经常被提及但很少被证实。
对于想要刷闪光御三家的玩家来说，最好的方法是在领取初始宝可梦前存档，然后反复读档直到出现闪光。野外遇到的闪光概率极低，但通过这种方法可以节省大量时间。性格修正道具也能在后期弥补初始属性的不足，所以不必过于纠结第一次遇到的个体。有些隐藏区域可能需要特定技能才能进入，那里往往有更高概率遇到稀有宝可梦。
每个主要城市周围几乎都有对应的栖息地，多和游戏中的NPC对话也能获得有用线索。游戏设计者显然希望玩家通过探索来发现这些内容，而不是简单地按图索骥。随着游戏进程推进，原先难以捕捉的御三家会变得相对容易遇到，这可能是为了平衡游戏难度而做的设计。
