舰船研究依托科研基地系统，玩家需通过技术档案解锁蓝图，技术档案可通过未央资助计划、任务奖励或商店购买获取。研究过程需消耗金属、晶体、重氢等资源，不同舰船类型对资源需求差异显著。科研团队数量直接影响研究效率，但研究时间固定不可压缩，仅能通过增加团队缩短周期。研究完成后生成建造图纸，可在造船厂建造或通过市场交易。
加密技术档案产出高阶蓝图概率更高，通用技术档案则适合基础舰船研发。玩家需权衡短期战力需求与长期发展，例如优先获取枪骑兵驱逐舰等泛用性强的舰船蓝图。技术储备系统提供保底机制，15个储备可兑换指定蓝图，为非酋玩家提供兜底方案。争议点在于是否投入比邻星币购买特别礼包，这类付费选项虽稳定产出蓝图，但性价比需结合玩家进度评估。
稀有元素是研究高等级舰船的关键瓶颈，需通过采矿平台或星系探索稳定获取。科研团队需根据基地等级逐步解锁，合理分配团队至不同研究项目能最大化效率。部分玩家主张集中资源突破单一舰种，另一派则认为均衡发展更适应多变的战场环境。采矿平台虽能提升10%-30%采集效率，但会引发同盟间的资源争夺，需谨慎规划矿区布局。
舰船研究直接关联舰队编成，例如海氏追随者型脉冲战斗机凭借高闪避率成为对舰特化单位，而卡利斯托鱼雷型则专精对抗大型舰船。蓝图子型号（如支援型、防空型）进一步细化战术选择，例如光锥级区域防空型能有效克制舰载机群。拆除无用舰船可回收模组与设计图，但需权衡战力损失与强化收益。
